沉水型水生植物根茎生于泥中，整个植株沉入水中，具发达的通气组织，利于进行气体交换。叶多为狭长或丝状，能吸收水中部分养分，在水下弱光的条件下也能正常生长发育。对水质有一定的要求，因为水质浑浊会影响其光合作用。花小，花期短（除部分植物外），以观叶为主。

沉水植物，如常绿苦草或狐尾澡植物，在水中担当着“造氧机”的角色，为池塘、河道中的其他生物提供生长所必需的溶解氧；同时，它们还能够除去水中过剩的养分，因而通过控制水藻生长而保持水体的清澈。

水藻过多会导致水质混浊、发绿、并遮挡水生植物和池塘生物健壮生长所必需的光线。沉水植物有：轮叶黑藻、金鱼藻、马来眼子菜、苦草、菹草、水菜花、海菜花、海菖蒲等。